一、增值稅

總分公司作為獨立的增值稅納稅人，總公司將存貨或機器設備無償劃轉給分公司的行為，應根據《增值稅暫行條例實施細則》第四條第八款規(guī)定處理，即將自產、委托加工或者購進的貨物無償贈送其他單位或者個人，總公司應視同銷售繳納增值稅。

二、企業(yè)所得稅

企業(yè)所得稅實行法人所得稅制，企業(yè)內部分支機構屬于企業(yè)的組成部分，不是一個獨立的法人實體，應由企業(yè)總機構統(tǒng)一代表企業(yè)進行匯總納稅。企業(yè)內部機構之間進行的融通資金、調劑資產、提供經營管理等行為，屬于內部業(yè)務活動，在繳納企業(yè)所得稅時，對于這些內部業(yè)務往來所產生的費用，均不計入收入和作為費用扣除。

國家稅務總局《關于企業(yè)處置資產所得稅處理問題的通知》(國稅函〔2008〕828號)第一條第四項規(guī)定，將資產在總機構及其分支機構之間轉移，企業(yè)發(fā)生該項情形的處置資產，除將資產轉移至境外以外，由于資產所有權屬在形式和實質上均不發(fā)生改變，可作為內部處置資產，不視同銷售確認收入，相關資產的計稅基礎延續(xù)計算。