自然人股東A持有甲有限公司30%的股權(quán)，現(xiàn)將其持有的股權(quán)全部轉(zhuǎn)讓給乙公司，作價(jià)3000萬元，該作價(jià)與A在甲公司中所持股權(quán)對(duì)應(yīng)的凈資產(chǎn)份額的公允價(jià)值一致。A與乙公司約定，股權(quán)轉(zhuǎn)讓款分兩次支付，第一次在股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議簽訂生效之日的次日支付1000萬元。第二次在股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議生效后的第3個(gè)月內(nèi)支付2000萬元。請(qǐng)問，A應(yīng)繳納的個(gè)人所得稅在何時(shí)繳納？如何繳納？

根據(jù)《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于發(fā)布<股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得個(gè)人所得稅管理辦法(試行)>的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2014年第67號(hào)）的規(guī)定，對(duì)個(gè)人轉(zhuǎn)讓股權(quán)應(yīng)納的個(gè)人所得稅何時(shí)納稅申進(jìn)行了規(guī)定。公告一共規(guī)定了六種情形，只要滿足其中之一，扣繳義務(wù)人、納稅人就需要依法在次月15日內(nèi)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅：（一）受讓方已支付或部分支付股權(quán)轉(zhuǎn)讓價(jià)款的；（二）股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議已簽訂生效的；（三）受讓方已經(jīng)實(shí)際履行股東職責(zé)或者享受股東權(quán)益的；（四）國(guó)家有關(guān)部門判決、登記或公告生效的；（五）本辦法第三條第四至第七項(xiàng)行為已完成的；（六）稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)定的其他有證據(jù)表明股權(quán)已發(fā)生轉(zhuǎn)移的情形。

可見，自然人A與乙公司簽訂的股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議生效之次月15日內(nèi)就應(yīng)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅，不需要等到辦理完股權(quán)變更登記手續(xù)才申報(bào)納稅。況且，現(xiàn)行的《個(gè)人所得稅法》規(guī)定，市場(chǎng)主體登記機(jī)關(guān)辦理個(gè)人轉(zhuǎn)讓股權(quán)變更登記時(shí)，應(yīng)當(dāng)查驗(yàn)完稅憑證。因此，乙公司應(yīng)于協(xié)議生效之次月十五日內(nèi)，按股權(quán)轉(zhuǎn)讓款減除A所持有的甲公司的股權(quán)原值和合理費(fèi)用后的余額為應(yīng)納稅所得額，一次性全額按“財(cái)產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得”扣繳個(gè)人所得稅，不管有無實(shí)際支付款項(xiàng)或者支付的款項(xiàng)能否覆蓋稅金。

這就要求交易雙方合理安排股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議的生效日期、轉(zhuǎn)讓款的支付方式和支付時(shí)間以及受讓人行使股東權(quán)利的時(shí)間等條款，為平順地繳納個(gè)人所得稅，辦理變更登記手續(xù)留足騰挪空間。