首先，我們了解一下什么是農(nóng)產(chǎn)品。

農(nóng)產(chǎn)品，是指種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、林業(yè)、牧業(yè)、水產(chǎn)業(yè)生產(chǎn)的各種植物、動物的初級產(chǎn)品。具體征稅范圍暫繼續(xù)按照《財政部、國家稅務總局關于印發(fā)〈農(nóng)業(yè)產(chǎn)品征稅范圍注釋〉的通知》（財稅字〔1995〕52號）及現(xiàn)行相關規(guī)定執(zhí)行，并包括掛面、干姜、姜黃、玉米胚芽、動物骨粒、按照《食品安全國家標準—巴氏殺菌乳》（GB19645—2010）生產(chǎn)的巴氏殺菌乳、按照《食品安全國家標準—滅菌乳》（GB25190—2010）生產(chǎn)的滅菌乳。

企業(yè)購入農(nóng)產(chǎn)品的途徑主要有以下四種：

1、從農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者手中購入農(nóng)產(chǎn)品

2、從批發(fā)零售農(nóng)產(chǎn)品（蔬菜、鮮活肉蛋）的納稅人手中購入農(nóng)產(chǎn)品

3、從國有糧食購銷企業(yè)購進免稅糧食和食用植物油

4、進口農(nóng)產(chǎn)品

下面我們來一一分析這四種情況下企業(yè)購入農(nóng)產(chǎn)品如何抵扣進項稅。

一、從農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)者手中購入農(nóng)產(chǎn)品

農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者包括從事農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的單位和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者個人，從事農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的單位包括一般納稅人和小規(guī)模納稅人兩種。從不同類型的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者手中購入農(nóng)產(chǎn)品其進項稅抵扣方法不盡相同。

1.從從事農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的單位購入農(nóng)產(chǎn)品，無論該單位是一般納稅人還是小規(guī)模納稅人，由于《中華人民共和國增值稅暫行條例》中規(guī)定農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品免征增值稅。因此銷售方應當開具的是免稅的普通發(fā)票，購買方企業(yè)根據(jù)從銷售方取得的普通發(fā)票上注明的買價，以9%的扣除率計算進項稅額。

2.從農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者個人手中購入農(nóng)產(chǎn)品，一般有兩種途徑取得發(fā)票，一種是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者個人通過稅務局申請代開普通發(fā)票，一種是購買方開具農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票。無論是哪種情況，企業(yè)可以以取得或者開具的農(nóng)產(chǎn)品銷售或者收購發(fā)票上注明的買價，以9%的扣除率計算進項稅額。

二、從批發(fā)零售農(nóng)產(chǎn)品（蔬菜、鮮活肉蛋）的納稅人手中購入農(nóng)產(chǎn)品

根據(jù)《財政部、國家稅務總局關于免征蔬菜流通環(huán)節(jié)增值稅有關問題的通知》（財稅〔2011〕137號）、《財政部、國家稅務總局關于免征部分鮮活肉蛋產(chǎn)品流通環(huán)節(jié)增值稅政策的通知》（財稅〔2012〕75號）兩個文件的規(guī)定，從事農(nóng)產(chǎn)品批發(fā)、零售的納稅人銷售的蔬菜、部分鮮活肉蛋產(chǎn)品，享受免征增值稅政策。

但同時《簡并增值稅稅率有關政策的通知》（財稅【2017】37號文）第四條規(guī)定：納稅人從批發(fā)、零售環(huán)節(jié)購進適用免征增值稅政策的蔬菜、部分鮮活肉蛋而取得的普通發(fā)票，不得作為計算抵扣進項稅額的憑證。

也就是說，納稅人批發(fā)、零售免稅農(nóng)產(chǎn)品，在批發(fā)、零售環(huán)節(jié)已經(jīng)享受了免征增值稅的優(yōu)惠政策，那么下游取得了免稅的普通發(fā)票，就不能再計算扣除進項稅額了。

除非，銷售方納稅人放棄免稅，開具增值稅專用發(fā)票，購進農(nóng)產(chǎn)品才可抵扣進項稅額。

簡言之，零售環(huán)節(jié)，總得有人來交增值稅。

假如銷售方真的放棄享受免征增值稅的優(yōu)惠政策，那么購買方如何抵扣進項稅額呢？

1.如果銷售方為一般納稅人，則銷售農(nóng)產(chǎn)品開具9%稅率的增值稅專用發(fā)票，那么購買方以取得的專用發(fā)票抵扣9%的進項稅額。

2.如果銷售方為小規(guī)模納稅人，則需要到稅務部門申請代開增值稅專用發(fā)票，申請代開的專用發(fā)票稅率為3%。依照《簡并增值稅稅率有關政策的通知》（財稅【2017】37號文）第一條中的規(guī)定，從按照簡易計稅方法依照3%征收率計算繳納增值稅的小規(guī)模納稅人取得增值稅專用發(fā)票的，以增值稅專用發(fā)票上注明的金額和11%（按照最新政策該稅率已調整為9%）的扣除率計算進項稅額。

從37號文件的規(guī)定來看，如果銷售方為小規(guī)模納稅人，雙方關系好的話，銷售方放棄免稅，還是很劃算的。

需要注意的是，從小規(guī)模納稅人處取得的增值稅普通發(fā)票，不能作為計算抵扣進項稅額的憑證。

三、從國有糧食購銷企業(yè)購進免稅糧食和食用植物油

《國家稅務總局關于加強免征增值稅貨物專用發(fā)票管理的通知》（國稅函〔2005〕第780號）中規(guī)定：增值稅一般納稅人銷售免稅貨物，一律不得開具專用發(fā)票（國有糧食購銷企業(yè)銷售免稅糧食除外）。也就是說雖然國有糧食購銷企業(yè)享受了免征增值稅的優(yōu)惠政策，但是依然可以開具增值稅專用發(fā)票，那么企業(yè)從國有糧食購銷企業(yè)購進糧食取得的增值稅專用發(fā)票是否都可以抵扣進項稅額呢？

《財政部、國家稅務總局關于糧食企業(yè)增值稅征免問題的通知》（財稅字(1999)198號）第六條規(guī)定：屬于增值稅一般納稅人的生產(chǎn)、經(jīng)營單位從國有糧食購銷企業(yè)購進的免稅糧食，可依據(jù)購銷企業(yè)開具的銷售發(fā)票注明的銷售額按13％的扣除率計算抵扣進項稅額；購進的免稅食用植物油，不得計算抵扣進項稅額。

在本條中需要特別注意的有兩點：

1.經(jīng)過國家2017年~2019年的三次稅率調整，本條中13%的扣除率現(xiàn)已調整為9%。

2.從國有糧食購銷企業(yè)購進的免稅食用植物油就算取得了增值稅專用發(fā)票，也不得計算抵扣進項稅額。

四、進口農(nóng)產(chǎn)品

企業(yè)進口農(nóng)產(chǎn)品，取得海關進口增值稅專用繳款書的，以海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額為進項稅額進行抵扣。否則不予抵扣進項稅額。

以上為企業(yè)通過四種不同途徑購入農(nóng)產(chǎn)品時進項稅額的抵扣方法，但除此之外，關于購入農(nóng)產(chǎn)品進項稅額如何抵扣的問題還有一個特殊規(guī)定：

《財政部 國家稅務總局關于在部分行業(yè)試行農(nóng)產(chǎn)品增值稅進項稅額核定扣除辦法的通知》（財稅〔2012〕38號）中規(guī)定：自2012年7月1日起，以購進農(nóng)產(chǎn)品為原料生產(chǎn)銷售液體乳及乳制品、酒及酒精、植物油的增值稅一般納稅人，納入農(nóng)產(chǎn)品增值稅進項稅額核定扣除試點范圍，其購進農(nóng)產(chǎn)品無論是否用于生產(chǎn)上述產(chǎn)品，增值稅進項稅額均按照《農(nóng)產(chǎn)品增值稅進項稅額核定扣除試點實施辦法》（附件1）的規(guī)定抵扣。

38號文的特殊規(guī)定只針對以購進農(nóng)產(chǎn)品為原料生產(chǎn)銷售液體乳及乳制品、酒及酒精、植物油的增值稅一般納稅人，除此之外的納稅人購進農(nóng)產(chǎn)品仍按現(xiàn)行增值稅的有關規(guī)定抵扣農(nóng)產(chǎn)品進項稅額。

具體的核定方法，請大家參考38號文的附件1《農(nóng)產(chǎn)品增值稅進項稅額核定扣除試點實施辦法》。

另外特別需要注意的是：

營業(yè)稅改征增值稅試點期間，納稅人購進用于生產(chǎn)銷售或委托受托加工13%稅率貨物的農(nóng)產(chǎn)品按照農(nóng)產(chǎn)品發(fā)票上注明的價款以9%的稅率計算扣除進項稅額。

納稅人購進農(nóng)產(chǎn)品既用于生產(chǎn)銷售或委托受托加工13%稅率貨物又用于生產(chǎn)銷售其他貨物服務的，應當分別核算用于生產(chǎn)銷售或委托受托加工13%稅率貨物和其他貨物服務的農(nóng)產(chǎn)品進項稅額。未分別核算的，統(tǒng)一以增值稅專用發(fā)票或海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額為進項稅額，或以農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票或銷售發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買價和9%的扣除率計算進項稅額。

總結：

從農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者手中購買的農(nóng)產(chǎn)品以取得的農(nóng)產(chǎn)品銷售發(fā)票或者銷售發(fā)票上注明的價款，按照9%的稅率計算抵扣。

從批發(fā)、零售農(nóng)產(chǎn)品的納稅人手中購買的免稅農(nóng)產(chǎn)品，如果銷售方已享受免稅政策，開具的是普通發(fā)票，購買方不能再計算抵扣進項稅；如果銷售方放棄免稅優(yōu)惠，開具了專用發(fā)票，購買方可以按照專用發(fā)票上注明的價款乘以9%的稅率計算抵扣（一般納稅人和小規(guī)模納稅人均按9%的稅率計算抵扣）。

從國有糧食購銷企業(yè)購買的免稅糧食可以取得增值稅專用發(fā)票，并按照專用發(fā)票上注明的價款乘以9%的稅率計算抵扣；但是從國有糧食購銷企業(yè)購買的免稅食用植物油就算取得了增值稅專用發(fā)票，也不得計算抵扣進項稅額。

企業(yè)進口農(nóng)產(chǎn)品，以海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額為進項稅額進行抵扣。

以購進農(nóng)產(chǎn)品為原料生產(chǎn)銷售液體乳及乳制品、酒及酒精、植物油的，具體參照財稅〔2012〕38號文件的規(guī)定處理。

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