先看一道例題：

【例題】一般納稅人從農(nóng)民手中購進(jìn)免稅農(nóng)產(chǎn)品用于生產(chǎn)餅干，收購發(fā)票上注明買價(jià)80000元，為運(yùn)輸該批貨物支付運(yùn)費(fèi)，取得了稅務(wù)機(jī)關(guān)代開的增值稅專用發(fā)票，上面注明運(yùn)費(fèi)1000元。計(jì)算允許抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額和采購成本。

答案：

進(jìn)項(xiàng)稅額＝80000×10%＋1000×3%＝8030（元）

采購成本＝80000×（1-10%）＋1000＝73000（元）

本題中非常顯而易見的知識(shí)點(diǎn)為：

1、取得（開具）農(nóng)產(chǎn)品銷售發(fā)票或收購發(fā)票的，以農(nóng)產(chǎn)品銷售發(fā)票或收購發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買價(jià)和9%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。（如果是直接從農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者手上購買的免稅農(nóng)產(chǎn)品，可以計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅）

2、納稅人購進(jìn)用于生產(chǎn)銷售或委托受托加工13%稅率貨物的農(nóng)產(chǎn)品，按照10%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。

還有一個(gè)隱藏的知識(shí)點(diǎn)：稅務(wù)機(jī)關(guān)代開的增值稅專用發(fā)票，適用征收率而不是稅率。

因?yàn)?，正常情況下，找稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票的為小規(guī)模納稅人，一般納稅人是自己開具增值稅專用發(fā)票的（目前小規(guī)模納稅人可以自愿選擇自行開具增值稅專用發(fā)票，也可以找稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票）。

國家稅務(wù)總局《關(guān)于印發(fā)〈稅務(wù)機(jī)關(guān)代開增值稅專用發(fā)票管理辦法（試行）〉的通知》（國稅發(fā)[2004]153 號(hào)）規(guī)定，已辦理稅務(wù)登記的小規(guī)模納稅人（包括個(gè)體經(jīng)營(yíng)者），以及國家稅務(wù)總局確定的其他可予代開增值稅專用發(fā)票的納稅人，可以申請(qǐng)代開專用發(fā)票。

因此，本題中計(jì)算運(yùn)費(fèi)的進(jìn)項(xiàng)稅額時(shí)，是用1000×3%（征收率），而不是1000×9%（稅率）。