航空運(yùn)輸代理服務(wù)的企業(yè)，一般既提供國(guó)內(nèi)的代理服務(wù)，也提供國(guó)外的代理服務(wù)，在增值稅上都可以差額征稅。

一， 對(duì)于提供境外航段機(jī)票代理服務(wù)的。 根據(jù)《關(guān)于租入固定資產(chǎn)進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣等增值稅政策的通知》（財(cái)稅〔2017〕90號(hào)）第三條規(guī)定：“自2018年1月1日起，航空運(yùn)輸銷售代理企業(yè)提供境外航段機(jī)票代理服務(wù)，以取得的全部?jī)r(jià)款和價(jià)外費(fèi)用，扣除向客戶收取并支付給其他單位或者個(gè)人的境外航段機(jī)票結(jié)算款和相關(guān)費(fèi)用后的余額為銷售額。差額征稅扣除的合法有效憑證包括：（1）支付給境內(nèi)單位或者個(gè)人的款項(xiàng)，以發(fā)票或行程單為合法有效憑證；（2）支付給境外單位或者個(gè)人的款項(xiàng)，以簽收單據(jù)為合法有效憑證，稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)簽收單據(jù)有疑義的，可以要求其提供境外公證機(jī)構(gòu)的確認(rèn)證明。

二、提供境內(nèi)機(jī)票代理服務(wù)。根據(jù)《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于明確中外合作辦學(xué)等若干增值稅征管問(wèn)題的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2018年第42號(hào)）第二條規(guī)定：“航空運(yùn)輸銷售代理企業(yè)提供境內(nèi)機(jī)票代理服務(wù)，以取得的全部?jī)r(jià)款和價(jià)外費(fèi)用，扣除向客戶收取并支付給航空運(yùn)輸企業(yè)或其他航空運(yùn)輸銷售代理企業(yè)的境內(nèi)機(jī)票凈結(jié)算款和相關(guān)費(fèi)用后的余額為銷售額。差額征稅扣除的合法有效憑證包括：（1）國(guó)際航空運(yùn)輸協(xié)會(huì)：（IATA）開賬與結(jié)算計(jì)劃（BSP）對(duì)賬單；（2）航空運(yùn)輸企業(yè)：簽收單據(jù)；（3）其他航空運(yùn)輸銷售代理企業(yè)：代理企業(yè)間的簽收單據(jù)。