企業(yè)所得稅匯算清繳是指處于生產(chǎn)經(jīng)營期間的納稅人依照稅收規(guī)定，在一定期限內(nèi)，自行計算一個納稅年度的應納稅所得額和應納所得稅額，比較預繳企業(yè)所得稅的數(shù)額，確定應補或者應退稅額，并填寫企業(yè)所得稅年度納稅申報表，向主管稅務機關辦理企業(yè)所得稅年度納稅申報，提供或留存?zhèn)洳橛嘘P資料，結清全年企業(yè)所得稅稅款的行為。

為加強企業(yè)所得稅征收管理，進一步規(guī)范企業(yè)所得稅匯算清繳管理工作，國家稅務總局根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》及其實施條例和《中華人民共和國稅收征管法》（以下簡稱《稅收征管法》）及其實施細則的有關規(guī)定，于2009年4月16日重新制定印發(fā)了《企業(yè)所得稅匯算清繳管理辦法》（國稅發(fā)（2009)79號，以下簡稱國稅發(fā)〔2009〕79號文件），以進一步規(guī)范企業(yè)所得稅匯算清繳工作?！镀髽I(yè)所得稅匯算清繳管理辦法》自2009年月1日起執(zhí)行。

1. 居民企業(yè)所得稅匯算清繳的納稅人范圍
2. 實行企業(yè)所得稅匯算清繳的納稅人依據(jù)國稅發(fā)（2009〕79號文件第三條第一款的規(guī)定，凡在納稅年度內(nèi)從事生產(chǎn)、經(jīng)營（包括試生產(chǎn)、試經(jīng)營），或在納稅年度中間終止經(jīng)營活動的納稅人，無論是否在減稅、免稅期間，也無論盈利或虧損，均應按照《企業(yè)所得稅法》及其實施條例和本辦法的有關規(guī)定進行企業(yè)所得稅匯算清繳。具體來說，實行企業(yè)所得稅匯算清繳的納稅人有：

1. 按查賬征收方式征收企業(yè)所得稅的居民企業(yè)。國稅發(fā)〔2009〕79號文件第十三條明確，實行跨地區(qū)經(jīng)營匯總繳納企業(yè)所得稅的納稅人，由統(tǒng)一計算應納稅所得額和應納所得稅額的總機構，按照上述規(guī)定，在匯算清繳期內(nèi)向所在地主管稅務機關辦理企業(yè)所得稅年度納稅申報，進行匯算清繳。因此，實行企業(yè)所得稅匯算清繳的納稅人根據(jù)是否在中國境內(nèi)跨地區(qū)設立分支機構，又可分為匯總納稅企業(yè)和單一納稅企業(yè)。居民企業(yè)在中國境內(nèi)跨地區(qū)設立不具有法人資格的分支機構的，該居民企業(yè)為匯總納稅企業(yè)。
2. 按核定應稅所得率征收方式征收企業(yè)所得稅的居民企業(yè)。

1. 不實行企業(yè)所得稅匯算清繳的納稅人

目前，不實行企業(yè)所得稅匯算清繳的納稅人有：

1. 跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)的各分支機構。國稅發(fā)〔2009〕79號文件第十三條要求，跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)的分支機構不進行匯算清繳，但應將分支機構的營業(yè)收支等情況在報總機構統(tǒng)一匯算清繳前報送分支機構所在地主管稅務機關?？倷C構應將分支機構及其所屬機構的營業(yè)收支納入總機構匯算清繳等情況報送各分支機構所在地主管稅務機關。
2. 實行核定定額征收方式征收企業(yè)所得稅的居民企業(yè)。

1. 關于匯總納稅企業(yè)的分支機構

1. 按有關規(guī)定需進行完整年度納稅申報的跨地區(qū)經(jīng)營企業(yè)分支機構，也應按規(guī)定填報企業(yè)所得稅年度納稅申報表，但不屬于標準的匯算清繳，其計算的應納所得稅額，有的按比例就地繳納，有的不就地繳納。

(2）依據(jù)《國家稅務總局關于印發(fā)＜跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法＞的公告》：

（國家稅務總局公告2012年第57號發(fā)布，國家稅務總局公告2018年第31號修改，以下簡稱稅務總局公告2012年第57號）

第十一條的規(guī)定，匯總納稅企業(yè)匯算清繳時，總機構除報送企業(yè)所得稅年度納稅申報表和年度財務報表外，還應報送匯總納稅企業(yè)分支機構所得稅分配表、各分支機構的年度財務報表和各分支機構參與企業(yè)年度納稅調整情況的說明；分支機構除報送企業(yè)所得稅年度納稅申報表（只填列部分項目）外，還應報送經(jīng)總機構所在地主管稅務機關受理的匯總納稅企業(yè)分支機構所得稅分配表、分支機構的年度財務報表（或年度財務狀況和營業(yè)收支情況）和分支機構參與企業(yè)年度納稅調整情況的說明。

因此，跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)的各分支機構盡管也要報送企業(yè)所得稅年度納稅申報表（只填列部分項目），但不屬于匯算清繳。